特定口座年間取引報告書が発行されたが 配当金が計上されていない。。

 配当金の受け取り方法が

株式数比例配分方式　でないと　載りません

証券会社でうけとっていませんから

証券会社で計上しようがありません。

たとえば　証券会社にも記載が

確定申告で国内株式の配当金の証明書が必要なのですが、発行できますか？ : SBI証券 (sbisec.co.jp)

特定口座 源泉徴収あり（配当等受入）で「株式数比例配分方式」により配当金を受取られた場合は、「特定口座年間取引報告書」に記載されます